Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms