Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLA1P09884 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLA1P09884 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLA1P09884 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms