Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CELF4Q9BZC1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms