Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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