Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms