Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms