Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms