Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVS71-1P61550 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms