Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms