Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT9P35527 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT9P35527 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT9P35527 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT9P35527 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT9P35527 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT9P35527 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT9P35527 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms