Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms