Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms