Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms