Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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