Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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