Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms