Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VEGFBP49765 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms