Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms