Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms