Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms