Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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