Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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