Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms