Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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