Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTBP2P56545 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms