Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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