Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRE11P49959 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRE11P49959 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRE11P49959 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRE11P49959 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms