Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms