Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 BNIP3P20-201ENST00000604827 578 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG3P32926 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG3P32926 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG3P32926 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG3P32926 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG3P32926 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG3P32926 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms