Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms