Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID3CA6NKF2 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms