Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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