Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
GTSF1Q8WW33 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms