Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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