Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFNP31947 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFNP31947 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFNP31947 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms