Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms