Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms