Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MAP3K4Q9Y6R4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MAP3K4Q9Y6R4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms