Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms