Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms