Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIT1Q9Y3P8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms