Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YBX2Q9Y2T7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YBX2Q9Y2T7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms