Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC8A2Q9UPR5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A2Q9UPR5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms