Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms