Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CIZ1Q9ULV3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CIZ1Q9ULV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms