Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC7AQ9ULT0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms