Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH3Q9ULD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH3Q9ULD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH3Q9ULD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms