Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH7Q9ULB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH7Q9ULB5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms