Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC9Q9UKV0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms