Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO4Q9UKT5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms